请教各位大师MSP相关问题！ - MSP引物设计 (Apr/14/2004 )
产物序列为7034-7207
7021 atcagacaag gcatgtgaac gccattatag cacagcgccc ggcatccagc aggactcact
7081 cgatgacagt tgtcaccgcc atcattgtta ttagcgtggg ccagggaggg ctgcgtaaaa
7141 gcagctggtg gaggagggag agatgccgtg ggaccgtctg ggttcgcatg cgtgaagtat
7201 tatctgggcc
文献所设计甲基化特异性引物为：
5-TGT GAA CGT TAT TAT AGT ATA GCG-3(sense)
5-CCA AAT AAT ACT TCA CGC ATA CG-3(antisense)
我认为引物应为：
5-TAT AAA CGC CAT TAT AGC ACA GCA-3(sense)
5-CCA AAT AAT ACT TCA CGC ATA CG-3(antisense)
请大家指点，谢谢！
-wqming222-
CODE
original: tgt gaa cgc cat tat agc aca gcg
mod: tgt gaa cgu uat tat agu aua gcg
primer: TGT GAA CGT TAT TAT AGT ATA GCG-
your: TAT AAA CGC CAT TAT AGC ACA GCA
mod: tgt gaa cgu uat tat agu aua gcg
primer: TGT GAA CGT TAT TAT AGT ATA GCG-
your: TAT AAA CGC CAT TAT AGC ACA GCA
文献是对的。
为什么你要将G换成A？ 如果引物是MSP的M引物， 所有非CpG的“C"都要变成”T“
你可用MethPrimer设计。
-hula-
非常感谢，我现在明白了，以后碰到困难再讨教哦！
-wqming222-